由于石斛性微寒，脘痞腹胀，呕恶便溏泄泻，口淡不渴、胃酸分泌过少者都属于脾胃虚寒，大量服用后会引起消化不良或腹泻。石斛具有生津滋阴的作用，比较适合阴虚的人服用，脾虚湿盛者大量服用会滋腻碍胃，引起消化不良。

感冒初期不宜吃，由于铁皮石斛偏于滋腻，服用后不利于感冒的治疗。

病早期阴未伤者，湿温病未化燥者，也就是说如果发热，但没有出现什么口大渴，大汗等损失体液的情况，属于热病早期阴未伤者不宜服用。头昏胀痛、胸闷不舒、小便不利属于湿温病未化燥者也不可用，因为过度滋阴就会使上述病痛难以去除；更不可用。

根据中药配伍原则，铁皮石斛不宜与寒水石，巴豆，炒僵蚕等中药同时使用，曾有药理实验证明，大剂量能抑制心脏，降低血压，抑制呼吸。