新鲜石斛汁多鲜嫩，容易腐烂变质，特别是霉雨季节，更不易保存。为了延长其食用时间，要用正确的方法保存。

新鲜的铁皮石斛贮藏时最主要的是不能密闭。许多人怕新鲜铁皮石斛失去水分，将铁皮石斛密闭在塑料袋中，结果导致霉变。新鲜的铁皮石斛在透气条件下贮藏一年也不会腐烂，第二年还能在节上萌发新芽，枯而不死、僵而不烂也是其非常神奇的地方。

为了不让其发芽，家中少量铁皮石斛鲜品可用纸或布袋包装后放入冰箱冷藏。带叶品，先将叶茎分开后存于0-7℃条件下冷藏，可确保3个月内无变质；若服用期超过3个月，用保鲜袋包好后冷冻，可保存半年。不带叶品真空包装，于0-7℃条件下可保质2半月，于冷冻条件下可保存8个月。