铁皮石斛最好不要冷冻。新鲜的铁皮石斛贮藏时最主要的是不能密闭。许多人怕新鲜铁皮石斛失去水分，将铁皮石斛密闭在塑料袋中，结果导致霉变。

铁皮石斛放在冰箱之前应该妥善密封，如果能接近真空封存，效果会更好。若无特殊要求，铁皮石斛应该放置在5℃左右的冷藏柜，不要冷冻，因为各种药材都含有不同程度的水分，经低温冷冻后水分结成冰，会对药材的有效成分造成损伤。铁皮石斛若需长期保存，可放在一个干净的玻璃瓶内然后投入适量的文火炒至暗黄的糯米，待凉后放入，将瓶盖封严，搁置在阴凉通风处。