首先，选择秋后采摘的石斛，质量最好；其次，铁皮石斛、细茎石斛、小叶石斛等为保存方便，会将之修剪、洗净后用微火加热后将之弯曲，加工成耳环状，称为耳环石斛、枫斗。

一般挑选干品石斛以色金黄或暗黄绿色、茎粗壮而饱满、质坚实略韧、易折断、嚼时黏性足甚至如脂膏口感为优质石斛，嚼时渣越少越为上品。其他如小环草等类型的丝藤状石斛则以外观金黄色，嚼之味道甘平为佳品。

此外，石斛买回来后，须存放于通风阴凉处，若在潮湿高温的环境下，很容易发酵变质。